熒光定量 PCR:通過(guò)設(shè)計(jì)特定的引物和探針,對(duì)微生物的特定基因進(jìn)行擴(kuò)增和定量分析,從而得出微生物的相對(duì)豐度。該方法靈敏度高、特異性強(qiáng),但只能檢測(cè)已知序列的微生物,且需要高質(zhì)量的 DNA 模板。
基因芯片技術(shù):將大量微生物的特異性基因探針固定在芯片上,與樣品中的 DNA 雜交,通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)來(lái)分析微生物的種類(lèi)和豐度。能同時(shí)檢測(cè)多種微生物,但芯片的制備和檢測(cè)成本較高,且存在一定的假陽(yáng)性和假陰性問(wèn)題。
高通量測(cè)序技術(shù):對(duì)樣品中的微生物 DNA 進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)分析測(cè)序數(shù)據(jù)來(lái)確定微生物的種類(lèi)和相對(duì)豐度??梢匀?、準(zhǔn)確地分析復(fù)雜樣品中的微生物群落,但數(shù)據(jù)分析復(fù)雜,成本也較高。